Для данного задания мне был предложен файл 'List20.txt', содержащий 28 ID. В результате в анализе обогащения участвовало 27 ID.
Это меньше, чем количество представленных ID. Такое получается из-за того, что возможно несоответствие ID между различными базами данных, и сервис указывает только количество прошедших в итоге ID.
Число GO-terms в выдаче: 20851
Ниже изображение с 10 самыми значимыми GO terms:
Граф с 5-ю самыми значимыми GO terms:
По графу видим, что все линии графа- связи принадлежности. Четыре находки являются частью друг друга (либо в них входят другие), одна же выделяется. Все находки объединяет их принадлежность к тем или иным метаболическим процессам.
Для 21 узла присутствует 3D- структура.
Видно, что из типов взаимодействия есть все. Меньше всего gene 'fusions', больше всего 'textmining'.
Говоря о консервативности, можно отметить, что гены высоко консервативны в Opisthokonta. Сравнительно малая встречаемость для бактерий (лишь гены OXSM и MCAT полностью присутствуют) и архей. Также OXSM в целом один из наиболее часто встречающихся ген и для эукариот.
Совместная экспрессия генов у человека заметно меньше, нежели у других организмов. Выделю наиболее вероятную совместную экспресию таких генов, как ACOT1 и ACOT2, FADS1 и FADS2 (для человека). Для других организмов 8 генов совсем не экспрессируются совместно, для всех остальных возможна совместная эскпрессия.